La estructura organizativa de Innicia se divide en 3 grandes áreas de trabajo:
ÁREA GENERANDO CONOCIMIENTO
Investigación, Evaluación y Captación de fondos.
ÁREA DE PROYECTOS
Digitalización, Escuela de Formación y Proyectos Innovadores.
ÁREA DE CALIDAD Y TRANSPARENCIA
Estratégica, Personas, Comunicación, Legal, Administración, Informática y digitalización.
EL EQUIPO HUMANO

Myriam Pérez Andrada, consultora experta en políticas sociales, lidera un equipo formado por 14 mujeres y 3 hombres de diferentes áreas: investigación, sociología, trabajo social, comunicación, digitalización, administración…